医药信息工程学院结合学校医药背景，推动IT学科融入“大健康”体系，打造具有复合优势的科研团队，在计算机图像处理与中医药信息模型、医院信息管理与信息系统、生物医学及电子信息工程等方向形成稳定团队开展科学研究。近年来，学院承担各级科研项目50余项，科研经费300余万元；新增实用新型专利及发明专利3项，软件著作权10余项，在国内外学术刊物公开发表论文近200篇，其中三大检索收录100余篇，出版教材、专著30余部。学院努力搭建科研合作平台，以“信息工程研究所”等研究机构为依托，促进产学研结合发展。学院与健康产业孵化基地共建“关联医学与移动健康实验室”，与广州衡必康信息科技有限公司联合共建“信息技术创业中心”，不断拓展服务领域和服务项目，顺利完成省部产学研结合、省市科技攻关项目及横向研发任务20余项，经费200余万元,在科技服务社会、服务地方经济工作中取得一定成果。